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我院宋纯鹏教授课题组在植物RNA表观遗传修饰研究方面取得进展
发布时间:2019年06月12日 16:08    作者:

201966日,Journal of Experimental Botany在线发表了我院棉花生物学国家重点实验室/植物逆境生物学重点实验室宋纯鹏教授为通讯作者的研究论文“Transcriptome-wide analysis of pseudouridylation of mRNA and non-coding RNAs in Arabidopsis

假尿苷修饰(pseudouridylationΨ)广泛存在于酵母及哺乳动物的mRNA及多种非编码RNA中,Ψ是尿苷(U)的异构化产物。然而,关于RNA特别是植物mRNA中的Ψs仍知之甚少。该研究通过假尿苷测序,首次在拟南芥mRNA中鉴定到Ψ位点,同时检测到了其他非编码RNA中的Ψ位点。研究发现,三联体密码子第一位的U更容易被假尿苷化;位于mRNA 3'非编码区的U5'非编码区和编码区的U相比有较少的异构化修饰;编码苯丙氨酸的密码子UUC最容易被假尿苷化;假尿嘧啶合酶SVR1基因缺失会导致叶绿体23S16S4.5S rRNA中一些Ψ修饰的减少,突变体中许多质体核糖体蛋白和光合作用相关蛋白显著减少。

该研究结果为拟南芥RNAs的假尿苷图谱和SVR1的生物学功能提供了新的见解,将为进一步利用Ψ修饰以调控植物基因表达和蛋白质生物合成奠定了基础。

 

文章连接:

https://academic.oup.com/jxb/advance-article/doi/10.1093/jxb/erz273/5512449

 

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